完整实施一项水利水电工程，往往是需要耗费较长时间的，在长期的施工中也可以看出这项工程的工程量是较大的。因为时间跨度大，在此期间的不确定因素也会增多，这些不确定因素有可能会增加施工难度，从而延长工期。为了保证施工的顺利进行，施工方应该尽量除掉或降低不确定因素的发生。将可能会发生的一些难点做好备案工作，以便在突发难点时，可以快速解决问题。水利工程的施工跨度时间长，会经历一年四季，春夏秋冬的温度降水量，湿度都不同，施工场地的环境，自然会有较大的差别，所以在真实施工时，工程设计人员应该根据这些变化来对施工方案做出相应的调整。水利水电工程面对的众多可变因素便是施工难点之一。

不可预知因素过多，这就考验了施工人员的技术水平和应变能力，对于施工人员来说这是一个很大的考验，对施工人员的技术水平和心理因素都有的标准。施工难度还受一些自然因素的影响，比如施工地点的转变，则施工地的土壤质地会发生变化，不同地点的施工方案则也不相同;施工地点的变化也会带来天气的变化，我国从南到北，从东到西，温度差异大，在施工方面则需要选用不同的施工材料以适用温度的变化。

另外在水利水电工程建设过程中，由于要调整坝坡及路面，使其达到图纸要求，会产生大量的土壤岩石弃渣，水利水电工程也包括为弃渣选择合理的安放地点。倘若随便放置弃渣，就会对周围产生影响，如果遇到暴雨，可能会引发泥石流，对于周围的人们的安全和财产造成了威胁，同时也破坏了周围的自然环境。倘若将弃渣到放置河边，弃渣可能会滑入河道，抬高河床，堵塞部分河流，导致上游河水溢岸，下游河水干涸，其后果不可想象。所以，合理放置弃渣也是水利水电工程的施工难点之一。